ห้องคลีนอาหารส่วนใหญ่จะใช้สำหรับการผลิตและการจัดเก็บเครื่องดื่ม นม ชีส เห็ด และผลิตภัณฑ์อาหารอื่นๆโดยทั่วไปสิ่งอำนวยความสะดวกเหล่านี้ประกอบด้วยห้องล็อกเกอร์ที่กำหนด ห้องอาบน้ำแบบเป่าลม แอร์ล็อค และพื้นที่การผลิตที่สะอาดอาหารมีความอ่อนไหวต่อการเน่าเสียเป็นพิเศษเนื่องจากมีอนุภาคจุลินทรีย์อยู่ในอากาศดังนั้นห้องปลอดเชื้อจึงมีบทบาทสำคัญในการเก็บรักษาอาหารโดยการกำจัดจุลินทรีย์อย่างมีประสิทธิภาพและคงคุณค่าทางโภชนาการและรสชาติของอาหารผ่านการเก็บรักษาที่อุณหภูมิต่ำและการฆ่าเชื้อที่อุณหภูมิสูง
