ห้องสะอาดของโรงพยาบาลมักใช้ในห้องผ่าตัดแบบโมดูลาร์ ห้องไอซียู ห้องแยกโรค และสถานพยาบาลอื่นๆห้องคลีนรูมทางการแพทย์ถือเป็นอุตสาหกรรมระดับมืออาชีพและมีความสำคัญ โดยเฉพาะห้องผ่าตัดแบบโมดูลาร์ที่มีข้อกำหนดที่เข้มงวดด้านความสะอาดของอากาศห้องผ่าตัดแบบโมดูลาร์เป็นส่วนสำคัญของโรงพยาบาลและประกอบด้วยห้องผ่าตัดหลักและพื้นที่เสริมระดับความสะอาดที่เหมาะสมที่สุดรอบๆ โต๊ะผ่าตัดคือคลาส 100 โดยปกติแนะนำให้ติดตั้งเพดานไหลแบบลามิเนตกรอง HEPA ที่ความสูงอย่างน้อย 3*3 เมตร เหนือโต๊ะผ่าตัด เพื่อให้ครอบคลุมโต๊ะผ่าตัดและเจ้าหน้าที่ทางการแพทย์การสร้างสภาพแวดล้อมที่ปลอดเชื้อสามารถลดอัตราการติดเชื้อของผู้ป่วยได้มากกว่า 10 เท่า ซึ่งช่วยลดการพึ่งพายาปฏิชีวนะและลดความเสียหายที่อาจเกิดขึ้นกับระบบภูมิคุ้มกันของมนุษย์
