ห้องปลอดเชื้อทางเภสัชกรรมส่วนใหญ่จะใช้สำหรับการผลิตขี้ผึ้ง ยาที่เป็นของแข็ง น้ำเชื่อม ชุดการให้สารให้สารละลาย และเภสัชภัณฑ์อื่นๆการปฏิบัติตามมาตรฐาน GMP และ ISO 14644 ถือเป็นเรื่องปกติในอุตสาหกรรมเป้าหมายหลักคือการสร้างสภาพแวดล้อมการผลิตปลอดเชื้อที่เข้มงวดทางวิทยาศาสตร์และเข้มงวด โดยมุ่งเน้นไปที่การควบคุมกระบวนการ การดำเนินงาน และระบบการจัดการที่แม่นยำ และกำจัดกิจกรรมทางชีวภาพ อนุภาคฝุ่น และการปนเปื้อนข้ามอย่างเข้มงวดเพื่อให้มั่นใจว่าการผลิตยามีคุณภาพสูงและถูกสุขลักษณะการตรวจสอบสภาพแวดล้อมการผลิตอย่างละเอียดและการควบคุมสิ่งแวดล้อมอย่างพิถีพิถันถือเป็นสิ่งสำคัญขอแนะนำให้ใช้เทคโนโลยีประหยัดพลังงานทุกครั้งที่เป็นไปได้หลังจากที่ห้องคลีนรูมมีคุณสมบัติครบถ้วนแล้ว จะต้องได้รับการอนุมัติจากสำนักงานคณะกรรมการอาหารและยาในพื้นที่ก่อนจึงจะเริ่มการผลิตได้
